Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNRD1Q9P1U0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNRD1Q9P1U0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms