Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP1Q9P0U3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SENP1Q9P0U3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms