Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L2

MARK1, Serine/threonine-protein kinase MARK1, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK1Q9P0L2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MARK1Q9P0L2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARK1Q9P0L2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARK1Q9P0L2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARK1Q9P0L2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARK1Q9P0L2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARK1Q9P0L2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MARK1Q9P0L2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARK1Q9P0L2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARK1Q9P0L2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARK1Q9P0L2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MARK1Q9P0L2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MARK1Q9P0L2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARK1Q9P0L2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARK1Q9P0L2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARK1Q9P0L2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARK1Q9P0L2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARK1Q9P0L2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARK1Q9P0L2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARK1Q9P0L2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARK1Q9P0L2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARK1Q9P0L2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MARK1Q9P0L2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARK1Q9P0L2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARK1Q9P0L2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARK1Q9P0L2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARK1Q9P0L2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARK1Q9P0L2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARK1Q9P0L2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARK1Q9P0L2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARK1Q9P0L2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARK1Q9P0L2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARK1Q9P0L2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARK1Q9P0L2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARK1Q9P0L2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MARK1Q9P0L2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MARK1Q9P0L2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms