Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC59Q9P031 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC59Q9P031 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms