Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EHD3Q9NZN3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EHD3Q9NZN3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms