Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMOD3Q9NYL9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TMOD3Q9NYL9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms