Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXC10Q9NYD6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXC10Q9NYD6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXC10Q9NYD6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
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