Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL28Q9NXS3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL28Q9NXS3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms