Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ASF1BQ9NVP2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASF1BQ9NVP2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms