Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SALL1Q9NSC2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SALL1Q9NSC2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms