Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PAPOLBQ9NRJ5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PAPOLBQ9NRJ5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms