Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DUOX1Q9NRD9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
DUOX1Q9NRD9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DUOX1Q9NRD9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DUOX1Q9NRD9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DUOX1Q9NRD9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
DUOX1Q9NRD9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DUOX1Q9NRD9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DUOX1Q9NRD9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DUOX1Q9NRD9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DUOX1Q9NRD9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27■■□□□ 1.91
DUOX1Q9NRD9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DUOX1Q9NRD9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DUOX1Q9NRD9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DUOX1Q9NRD9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DUOX1Q9NRD9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DUOX1Q9NRD9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27■■□□□ 1.91
DUOX1Q9NRD9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DUOX1Q9NRD9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DUOX1Q9NRD9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DUOX1Q9NRD9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DUOX1Q9NRD9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DUOX1Q9NRD9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
DUOX1Q9NRD9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DUOX1Q9NRD9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DUOX1Q9NRD9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DUOX1Q9NRD9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DUOX1Q9NRD9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DUOX1Q9NRD9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DUOX1Q9NRD9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DUOX1Q9NRD9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DUOX1Q9NRD9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DUOX1Q9NRD9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DUOX1Q9NRD9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DUOX1Q9NRD9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms