Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPHNQ9NQX3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPHNQ9NQX3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms