Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC24A3Q9HC58 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC24A3Q9HC58 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms