Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L4

TMEM60, Transmembrane protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM60Q9H2L4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM60Q9H2L4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM60Q9H2L4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms