Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Y0

ATG10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG10Q9H0Y0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG10Q9H0Y0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG10Q9H0Y0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ATG10Q9H0Y0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms