Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0M0

WWP1, NEDD4-like E3 ubiquitin-protein ligase WWP1, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WWP1Q9H0M0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
WWP1Q9H0M0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WWP1Q9H0M0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WWP1Q9H0M0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms