Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM39BQ9GZU3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM39BQ9GZU3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms