Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2OQ9C0C9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2OQ9C0C9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE2OQ9C0C9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms