Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP3Q9BWW4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP3Q9BWW4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms