Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVI0

PHF20, PHD finger protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF20Q9BVI0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF20Q9BVI0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PHF20Q9BVI0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF20Q9BVI0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF20Q9BVI0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF20Q9BVI0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF20Q9BVI0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF20Q9BVI0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF20Q9BVI0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF20Q9BVI0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF20Q9BVI0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF20Q9BVI0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF20Q9BVI0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PHF20Q9BVI0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF20Q9BVI0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF20Q9BVI0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF20Q9BVI0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF20Q9BVI0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF20Q9BVI0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF20Q9BVI0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF20Q9BVI0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF20Q9BVI0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF20Q9BVI0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF20Q9BVI0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF20Q9BVI0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHF20Q9BVI0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHF20Q9BVI0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms