Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC5

C2orf49, Ashwin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf49Q9BVC5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2orf49Q9BVC5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2orf49Q9BVC5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2orf49Q9BVC5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2orf49Q9BVC5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2orf49Q9BVC5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C2orf49Q9BVC5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C2orf49Q9BVC5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C2orf49Q9BVC5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C2orf49Q9BVC5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2orf49Q9BVC5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C2orf49Q9BVC5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C2orf49Q9BVC5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf49Q9BVC5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf49Q9BVC5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf49Q9BVC5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf49Q9BVC5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2orf49Q9BVC5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms