Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NDC1Q9BTX1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms