Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PI4K2AQ9BTU6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PI4K2AQ9BTU6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms