Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NDFIP1Q9BT67 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NDFIP1Q9BT67 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDFIP1Q9BT67 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDFIP1Q9BT67 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDFIP1Q9BT67 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDFIP1Q9BT67 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms