Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NIPSNAP3BQ9BS92 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NIPSNAP3BQ9BS92 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms