Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR46

C20orf78, Putative uncharacterized protein C20orf78, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf78Q9BR46 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C20orf78Q9BR46 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C20orf78Q9BR46 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C20orf78Q9BR46 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C20orf78Q9BR46 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C20orf78Q9BR46 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C20orf78Q9BR46 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C20orf78Q9BR46 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C20orf78Q9BR46 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C20orf78Q9BR46 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C20orf78Q9BR46 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C20orf78Q9BR46 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C20orf78Q9BR46 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C20orf78Q9BR46 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C20orf78Q9BR46 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C20orf78Q9BR46 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C20orf78Q9BR46 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C20orf78Q9BR46 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C20orf78Q9BR46 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C20orf78Q9BR46 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C20orf78Q9BR46 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C20orf78Q9BR46 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C20orf78Q9BR46 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C20orf78Q9BR46 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C20orf78Q9BR46 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C20orf78Q9BR46 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C20orf78Q9BR46 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C20orf78Q9BR46 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C20orf78Q9BR46 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C20orf78Q9BR46 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C20orf78Q9BR46 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C20orf78Q9BR46 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms