Protein–RNA interactions for Protein: Q99811

PRRX2, Paired mesoderm homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX2Q99811 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRRX2Q99811 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRRX2Q99811 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRRX2Q99811 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms