Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PKP4Q99569 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PKP4Q99569 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms