Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP88Q99567 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP88Q99567 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP88Q99567 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP88Q99567 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP88Q99567 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUP88Q99567 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP88Q99567 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP88Q99567 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP88Q99567 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP88Q99567 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP88Q99567 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUP88Q99567 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUP88Q99567 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUP88Q99567 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUP88Q99567 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUP88Q99567 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms