Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP19Q99542 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP19Q99542 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP19Q99542 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms