Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C9orf72Q96LT7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C9orf72Q96LT7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C9orf72Q96LT7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms