Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC136Q96JN2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CCDC136Q96JN2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC136Q96JN2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms