Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HIC2Q96JB3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIC2Q96JB3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 539.2 ms