Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMARCD1Q96GM5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMARCD1Q96GM5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 314.1 ms