Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CALML4Q96GE6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CALML4Q96GE6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CALML4Q96GE6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CALML4Q96GE6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CALML4Q96GE6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CALML4Q96GE6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALML4Q96GE6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALML4Q96GE6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALML4Q96GE6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALML4Q96GE6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALML4Q96GE6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALML4Q96GE6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALML4Q96GE6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALML4Q96GE6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALML4Q96GE6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALML4Q96GE6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALML4Q96GE6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALML4Q96GE6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALML4Q96GE6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms