Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEIL1Q96FI4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NEIL1Q96FI4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms