Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGBD4Q96DM1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGBD4Q96DM1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms