Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SHISA4Q96DD7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHISA4Q96DD7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms