Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL29Q96CT2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL29Q96CT2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms