Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC127Q96BQ5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC127Q96BQ5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC127Q96BQ5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC127Q96BQ5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC127Q96BQ5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC127Q96BQ5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC127Q96BQ5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC127Q96BQ5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC127Q96BQ5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC127Q96BQ5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC127Q96BQ5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC127Q96BQ5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC127Q96BQ5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC127Q96BQ5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC127Q96BQ5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC127Q96BQ5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC127Q96BQ5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC127Q96BQ5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC127Q96BQ5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC127Q96BQ5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC127Q96BQ5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC127Q96BQ5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC127Q96BQ5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC127Q96BQ5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC127Q96BQ5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC127Q96BQ5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC127Q96BQ5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC127Q96BQ5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC127Q96BQ5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC127Q96BQ5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC127Q96BQ5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms