Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERCC4Q92889 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC4Q92889 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms