Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSC1Q92574 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSC1Q92574 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSC1Q92574 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms