Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CASKIN2Q8WXE0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASKIN2Q8WXE0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms