Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHD5Q8TDI0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHD5Q8TDI0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms