Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HELQQ8TDG4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELQQ8TDG4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms