Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MDM1Q8TC05 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM1Q8TC05 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms