Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MYRIPQ8NFW9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MYRIPQ8NFW9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms