Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BEST4Q8NFU0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms