Protein–RNA interactions for Protein: Q8N715

CCDC185, Coiled-coil domain-containing protein 185, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC185Q8N715 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC185Q8N715 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC185Q8N715 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC185Q8N715 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC185Q8N715 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC185Q8N715 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC185Q8N715 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC185Q8N715 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC185Q8N715 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC185Q8N715 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC185Q8N715 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC185Q8N715 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC185Q8N715 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC185Q8N715 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC185Q8N715 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC185Q8N715 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC185Q8N715 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC185Q8N715 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC185Q8N715 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC185Q8N715 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC185Q8N715 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC185Q8N715 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC185Q8N715 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC185Q8N715 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC185Q8N715 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC185Q8N715 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC185Q8N715 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC185Q8N715 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC185Q8N715 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC185Q8N715 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC185Q8N715 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC185Q8N715 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC185Q8N715 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC185Q8N715 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC185Q8N715 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms